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應(yīng)用案例
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應(yīng)用視界|無需滅菌!甜高粱汁“變身”L-乳酸:基于MMC篩選高耐受凝結(jié)芽孢桿菌

來源:   作者: 發(fā)布日期:2025-04-29 訪問量:257

引言:

近日,中國科學(xué)院近代物理研究所胡偉青年研究員團(tuán)隊與清華大學(xué)化學(xué)工程系張翀教授團(tuán)隊聯(lián)袂主導(dǎo)的研究成果“ Engineering Bacillus coagulans with high osmotic tolerance for enhancing L-lactic acid production using sweet sorghum juice coupled with acid-pretreated soybean meal under unsterile conditions ”在《 Industrial Crops & Products 》期刊上發(fā)表。

1


本研究聚焦于凝結(jié)芽孢桿菌在促進(jìn)非食用甜高粱發(fā)酵成高產(chǎn)乳酸上的潛力,使用蘭州重離子研究裝置(HIRFL)構(gòu)建突變體庫,結(jié)合全自動高通量微生物液滴培養(yǎng)系統(tǒng)(Microbial Microdroplet Culture system,MMC)進(jìn)行高通量、自動化液滴富集、篩選,最終得到具有高滲透壓耐受性的凝結(jié)芽孢桿菌,與親本菌株相比,其L-乳酸產(chǎn)量顯著提高1倍。此外,該工程菌結(jié)合酸水解豆粕和維生素B (VB)化合物在開放式非無菌條件下單批次發(fā)酵甜高粱汁,23h發(fā)酵可產(chǎn)L-乳酸113.5 g / L,光學(xué)純度高達(dá)99.8%,顯示出更高效的甜高粱高分子級L-乳酸生物制造潛力。


一、研究背景

1.L-乳酸的市場需求與生產(chǎn)挑戰(zhàn)性

L-乳酸是生物可降解塑料(如聚乳酸)的關(guān)鍵原料,市場需求持續(xù)增長。

傳統(tǒng)生產(chǎn)依賴糧食基原料(如玉米淀粉),存在與糧食安全沖突、成本高的問題。

非糧原料利用(如甜高粱汁、豆粕)成為可持續(xù)生產(chǎn)的研究方向,但存在發(fā)酵效率低、預(yù)處理成本高等瓶頸。


2.非滅菌發(fā)酵的工業(yè)意義

傳統(tǒng)發(fā)酵需嚴(yán)格滅菌,能耗高且設(shè)備復(fù)雜,增加生產(chǎn)成本。

開放(非滅菌)發(fā)酵可大幅降低能耗和操作難度,但需解決雜菌污染問題,對菌株耐受性提出更高要求。


3.菌株選擇與滲透壓耐受性缺陷

凝結(jié)芽孢桿菌(Bacillus coagulans)是理想候選菌(耐酸、高溫發(fā)酵、L-乳酸高產(chǎn)),但其低滲透壓耐受性限制了在非滅菌高糖環(huán)境中的應(yīng)用。

甜高粱汁含高濃度糖分(滲透壓高),易導(dǎo)致菌體生長抑制,需通過基因工程提升菌株適應(yīng)性。


4.原料利用的協(xié)同策略

?甜高粱汁:富含可發(fā)酵糖,但碳源單一,需補充氮源。

酸預(yù)處理豆粕:提供低成本氮源,但含抑制性副產(chǎn)物(如鹽離子、酸降解物),進(jìn)一步增加滲透壓壓力。

需開發(fā)菌株同時耐受高滲透壓和抑制物,實現(xiàn)原料高效共利用。


二、菌株篩選與工程菌株驗證

1.菌株篩選

(1) 菌株來源與預(yù)處理

菌種選擇:使用凝結(jié)芽孢桿菌(Bacillus coagulans)CICC 23843,培養(yǎng)方法參照Yan等(2024)的文獻(xiàn)。

菌體收集:將細(xì)菌培養(yǎng)至OD????≈ 0.96,用30%甘油懸浮保存。

(2) 突變庫構(gòu)建

重離子誘變:在蘭州重離子研究裝置(HIRFL)中,用12C??離子束輻照處理菌體,誘導(dǎo)基因突變。

初代培養(yǎng):取100 μL處理后的菌懸液,在42 °C下于MRS固體培養(yǎng)基中培養(yǎng)24小時。

(3) MMC富集

菌體預(yù)處理:用富集培養(yǎng)基洗滌菌體(調(diào)整OD???≈0.13)。

微滴封裝:通過MMC(天木生物)生成微升級液滴,將菌體封裝至微滴中(2~3 μL / 微滴,共50個微滴)。

富集條件:

①溫度:41 °C。

②培養(yǎng)時間:8小時/周期。

③循環(huán)操作:每周期將培養(yǎng)好的液滴接種至使用新鮮培養(yǎng)基、新生成的液滴中,共進(jìn)行40個循環(huán)。

(4) 高滲耐受菌株篩選

目標(biāo)微滴分離:選擇OD???值高的微滴,轉(zhuǎn)移至無菌EP管。

高鹽平板篩選:將菌液涂布于含1 M NaCl的MRS平板,篩選形成大菌落的耐受株。

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2.工程菌株驗證

(1) 甜高粱汁的預(yù)處理

熱石灰澄清:用氧化鈣(CaO)調(diào)節(jié)甜高粱汁pH至10.0,60 ℃恒溫維持1小時,離心后取上清液。

中和處理:用磷酸調(diào)節(jié)上清液pH至7.0,繼續(xù)反應(yīng)1小時后離心。

酸水解:用98%濃硫酸調(diào)節(jié)pH至2.0,90℃水解1小時,加入40%氫氧化鈣(Ca(OH)?)懸浮液中和至pH 6.8-7.0。

(2) 豆粕的預(yù)處理

酸水解:將160 g干豆粕與800 g 6.25%硫酸溶液混合,90 ℃水解24小時。

中和處理:加入40%氫氧化鈣( Ca(OH)??)懸浮液調(diào)節(jié)pH至6.8-7.0。

(3) 發(fā)酵培養(yǎng)條件

接種準(zhǔn)備:使用40-5007菌株作為種子液,接種量為10%(v/v)。

發(fā)酵參數(shù):發(fā)酵罐體積:5 L(實際裝液量2.8 L)。

培養(yǎng)基組成:預(yù)處理后的甜高粱汁+豆粕水解液。

培養(yǎng)條件:溫度:50 ℃;轉(zhuǎn)速:180 rpm;通氣量:0.9 L/min。

3


三、主要成果

本研究成功建立了一個基于重離子誘變結(jié)合微滴富集的高效育種平臺,并構(gòu)建了一株具有高滲透耐受性的L-乳酸高產(chǎn)菌株。使用酸預(yù)處理的豆粕和最佳添加的 VB 化合物,工程菌株在 5 L分批生物反應(yīng)器中轉(zhuǎn)化酸預(yù)處理的甜高粱汁,L-乳酸產(chǎn)量為 113.5 g/L、生產(chǎn)率 4.9 g/L/h,并且在非無菌條件下產(chǎn)率為95%。該工程菌株有望以非食用甜高粱為原料實現(xiàn)L-乳酸的高效、低成本生產(chǎn)。


四、研究亮點

1.高滲透壓耐受菌株的創(chuàng)制

重離子誘變+高通量微滴篩選:通過重離子束誘變結(jié)合自動化微滴微流控技術(shù)—MMC,篩選出滲透壓耐受性顯著提升的凝結(jié)芽孢桿菌突變株。與原始菌株相比,突變株在高糖環(huán)境下的L-乳酸產(chǎn)量和耐受性均顯著提高,為甜高粱汁高效轉(zhuǎn)化奠定基礎(chǔ)。


2.營養(yǎng)優(yōu)化提升轉(zhuǎn)化效率

維生素B補充:通過添加維生素B族,進(jìn)一步強化菌株代謝活力,提升糖酸轉(zhuǎn)化率。

酸預(yù)處理豆粕協(xié)同利用:豆粕經(jīng)酸水解后作為低成本氮源,與甜高粱汁(碳源)復(fù)配,提高乳酸產(chǎn)率和生產(chǎn)效率。


3.非滅菌工藝下的高效生產(chǎn)

開放發(fā)酵突破:在無需滅菌的條件下,工程菌單批次發(fā)酵23小時即產(chǎn)出 113.5 g/L L-乳酸,光學(xué)純度達(dá) 99.8% 。


關(guān)于MMC

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關(guān)于我們

天木生物專注于生物育種領(lǐng)域的高端儀器裝備的開發(fā)與應(yīng)用,致力于通過高效的突變技術(shù)和高通量篩選技術(shù),改造提升產(chǎn)業(yè)傳統(tǒng)菌種開發(fā)模式,為生物制造產(chǎn)業(yè)提質(zhì)增效,提升我國生物產(chǎn)業(yè)的核心競爭力。?致力于為行業(yè)“細(xì)胞和菌種開發(fā)與篩選效率低”、“相關(guān)裝備成本昂貴”、“產(chǎn)業(yè)化落地困難”等難題提供優(yōu)秀的解決方案。

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引言:

近日,中國科學(xué)院近代物理研究所胡偉青年研究員團(tuán)隊與清華大學(xué)化學(xué)工程系張翀教授團(tuán)隊聯(lián)袂主導(dǎo)的研究成果“ Engineering Bacillus coagulans with high osmotic tolerance for enhancing L-lactic acid production using sweet sorghum juice coupled with acid-pretreated soybean meal under unsterile conditions ”在《 Industrial Crops & Products 》期刊上發(fā)表。

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本研究聚焦于凝結(jié)芽孢桿菌在促進(jìn)非食用甜高粱發(fā)酵成高產(chǎn)乳酸上的潛力,使用蘭州重離子研究裝置(HIRFL)構(gòu)建突變體庫,結(jié)合全自動高通量微生物液滴培養(yǎng)系統(tǒng)(Microbial Microdroplet Culture system,MMC)進(jìn)行高通量、自動化液滴富集、篩選,最終得到具有高滲透壓耐受性的凝結(jié)芽孢桿菌,與親本菌株相比,其L-乳酸產(chǎn)量顯著提高1倍。此外,該工程菌結(jié)合酸水解豆粕和維生素B (VB)化合物在開放式非無菌條件下單批次發(fā)酵甜高粱汁,23h發(fā)酵可產(chǎn)L-乳酸113.5 g / L,光學(xué)純度高達(dá)99.8%,顯示出更高效的甜高粱高分子級L-乳酸生物制造潛力。


一、研究背景

1.L-乳酸的市場需求與生產(chǎn)挑戰(zhàn)性

L-乳酸是生物可降解塑料(如聚乳酸)的關(guān)鍵原料,市場需求持續(xù)增長。

傳統(tǒng)生產(chǎn)依賴糧食基原料(如玉米淀粉),存在與糧食安全沖突、成本高的問題。

非糧原料利用(如甜高粱汁、豆粕)成為可持續(xù)生產(chǎn)的研究方向,但存在發(fā)酵效率低、預(yù)處理成本高等瓶頸。


2.非滅菌發(fā)酵的工業(yè)意義

傳統(tǒng)發(fā)酵需嚴(yán)格滅菌,能耗高且設(shè)備復(fù)雜,增加生產(chǎn)成本。

開放(非滅菌)發(fā)酵可大幅降低能耗和操作難度,但需解決雜菌污染問題,對菌株耐受性提出更高要求。


3.菌株選擇與滲透壓耐受性缺陷

凝結(jié)芽孢桿菌(Bacillus coagulans)是理想候選菌(耐酸、高溫發(fā)酵、L-乳酸高產(chǎn)),但其低滲透壓耐受性限制了在非滅菌高糖環(huán)境中的應(yīng)用。

甜高粱汁含高濃度糖分(滲透壓高),易導(dǎo)致菌體生長抑制,需通過基因工程提升菌株適應(yīng)性。


4.原料利用的協(xié)同策略

?甜高粱汁:富含可發(fā)酵糖,但碳源單一,需補充氮源。

酸預(yù)處理豆粕:提供低成本氮源,但含抑制性副產(chǎn)物(如鹽離子、酸降解物),進(jìn)一步增加滲透壓壓力。

需開發(fā)菌株同時耐受高滲透壓和抑制物,實現(xiàn)原料高效共利用。


二、菌株篩選與工程菌株驗證

1.菌株篩選

(1) 菌株來源與預(yù)處理

菌種選擇:使用凝結(jié)芽孢桿菌(Bacillus coagulans)CICC 23843,培養(yǎng)方法參照Yan等(2024)的文獻(xiàn)。

菌體收集:將細(xì)菌培養(yǎng)至OD????≈ 0.96,用30%甘油懸浮保存。

(2) 突變庫構(gòu)建

重離子誘變:在蘭州重離子研究裝置(HIRFL)中,用12C??離子束輻照處理菌體,誘導(dǎo)基因突變。

初代培養(yǎng):取100 μL處理后的菌懸液,在42 °C下于MRS固體培養(yǎng)基中培養(yǎng)24小時。

(3) MMC富集

菌體預(yù)處理:用富集培養(yǎng)基洗滌菌體(調(diào)整OD???≈0.13)。

微滴封裝:通過MMC(天木生物)生成微升級液滴,將菌體封裝至微滴中(2~3 μL / 微滴,共50個微滴)。

富集條件:

①溫度:41 °C。

②培養(yǎng)時間:8小時/周期。

③循環(huán)操作:每周期將培養(yǎng)好的液滴接種至使用新鮮培養(yǎng)基、新生成的液滴中,共進(jìn)行40個循環(huán)。

(4) 高滲耐受菌株篩選

目標(biāo)微滴分離:選擇OD???值高的微滴,轉(zhuǎn)移至無菌EP管。

高鹽平板篩選:將菌液涂布于含1 M NaCl的MRS平板,篩選形成大菌落的耐受株。

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2.工程菌株驗證

(1) 甜高粱汁的預(yù)處理

熱石灰澄清:用氧化鈣(CaO)調(diào)節(jié)甜高粱汁pH至10.0,60 ℃恒溫維持1小時,離心后取上清液。

中和處理:用磷酸調(diào)節(jié)上清液pH至7.0,繼續(xù)反應(yīng)1小時后離心。

酸水解:用98%濃硫酸調(diào)節(jié)pH至2.0,90℃水解1小時,加入40%氫氧化鈣(Ca(OH)?)懸浮液中和至pH 6.8-7.0。

(2) 豆粕的預(yù)處理

酸水解:將160 g干豆粕與800 g 6.25%硫酸溶液混合,90 ℃水解24小時。

中和處理:加入40%氫氧化鈣( Ca(OH)??)懸浮液調(diào)節(jié)pH至6.8-7.0。

(3) 發(fā)酵培養(yǎng)條件

接種準(zhǔn)備:使用40-5007菌株作為種子液,接種量為10%(v/v)。

發(fā)酵參數(shù):發(fā)酵罐體積:5 L(實際裝液量2.8 L)。

培養(yǎng)基組成:預(yù)處理后的甜高粱汁+豆粕水解液。

培養(yǎng)條件:溫度:50 ℃;轉(zhuǎn)速:180 rpm;通氣量:0.9 L/min。

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三、主要成果

本研究成功建立了一個基于重離子誘變結(jié)合微滴富集的高效育種平臺,并構(gòu)建了一株具有高滲透耐受性的L-乳酸高產(chǎn)菌株。使用酸預(yù)處理的豆粕和最佳添加的 VB 化合物,工程菌株在 5 L分批生物反應(yīng)器中轉(zhuǎn)化酸預(yù)處理的甜高粱汁,L-乳酸產(chǎn)量為 113.5 g/L、生產(chǎn)率 4.9 g/L/h,并且在非無菌條件下產(chǎn)率為95%。該工程菌株有望以非食用甜高粱為原料實現(xiàn)L-乳酸的高效、低成本生產(chǎn)。


四、研究亮點

1.高滲透壓耐受菌株的創(chuàng)制

重離子誘變+高通量微滴篩選:通過重離子束誘變結(jié)合自動化微滴微流控技術(shù)—MMC,篩選出滲透壓耐受性顯著提升的凝結(jié)芽孢桿菌突變株。與原始菌株相比,突變株在高糖環(huán)境下的L-乳酸產(chǎn)量和耐受性均顯著提高,為甜高粱汁高效轉(zhuǎn)化奠定基礎(chǔ)。


2.營養(yǎng)優(yōu)化提升轉(zhuǎn)化效率

維生素B補充:通過添加維生素B族,進(jìn)一步強化菌株代謝活力,提升糖酸轉(zhuǎn)化率。

酸預(yù)處理豆粕協(xié)同利用:豆粕經(jīng)酸水解后作為低成本氮源,與甜高粱汁(碳源)復(fù)配,提高乳酸產(chǎn)率和生產(chǎn)效率。


3.非滅菌工藝下的高效生產(chǎn)

開放發(fā)酵突破:在無需滅菌的條件下,工程菌單批次發(fā)酵23小時即產(chǎn)出 113.5 g/L L-乳酸,光學(xué)純度達(dá) 99.8% 。


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